Duże I/O Dysku/Ów Powoduję Przywieszenie Systemu.

morsik · Listopad 9, 2010

Witam, rzadko pisze tematy na forum gdyz przewaznie radze sobie z problemami. No cóz, nie tym razem.

Pod koniec wakacji kupilem nowy komputer i od poczatku "cos" jest nie tak. To "cos" to "cos" zwiazane z dyskami.

Konkrenie, to caly system sie przywiesza na chwile (okolo 10 sekund) gdy sa wykonywane jakies duze operacje na plikach. Malych plików to nie dotyczy, Chyba, ze musi odczytac wiele takich malych plików.

Dla przykladu: rozpakowywanie duzych archiwów, kompilacja programów (dla mnie nadal dziwne, bo na starym laptopie z Celeronem 1,8Ghz nie mialem tego problemu).

Specifikacja sprzetu:

Plyta glówna: Gigabyte 770TA-UD3

Procesor: AMD Athlon II X4 640 (3.01Ghz)

Pamiec: Corsair 2G (mam jeszcze 2G ale okazalo sie, ze walnieta - musze oddac na gwarancje)

Dyski: 2 x Western Digital 640G 7200RPM 64MB cache.

Od razu mówie, ze wykluczam plyte glówna. Dlaczego? Ano dlatego, ze na plycie glównej mam 6 portów SATA, do 1 i 2 wpiete sa dyski, a do 5 naped BluRay, tak wiec wszystko jedzie na tej samej magistrali - a problem nie dotyczy napedu i systemów odpalonych z Live.

/boot, / oraz /home sa na RAID1 (mdadm), zas /mnt/data na RAID0 (generalnie muzyka i filmy).

Problem wystepuje teraz na Gentoo i wystepowal na Archu - wiec jest niezalezny od dystrybucji. To samo mam na OS X (nie bijcie). Problem "oczywiscie" na Windowsie nie wystepuje (wlasciwie to nie jestem do konca pewien... chyba jednak wystepuje - jedyne co robilem duzego to instalowalem GTA (15GB) i wtedy tez sie cielo)...

Próbowalem juz róznych opcji. Tutaj mój fstab (szukalem wielu opcji optymalizacyjnych):

/dev/md1	/boot		ext2	noatime,data=writeback,nobh,defaults	1 2
/dev/md5	/		ext4	noatime,data=writeback,nobh,defaults	0 1
/dev/md6	/home		ext4	noatime,data=writeback,nobh,defaults	0 0
/dev/md127	/mnt/data	ext4	noatime,data=writeback,nobh,defaults,users,rw	0 0

W BIOSie ustawione AHCI na wszystkich 6 portach SATA (mozliwe opcje: IDE, SATA, RAID).

W logach nic nie pisze, a jako, ze mam gentoo to wlaczylem w jadrze nawet opcje debugujace - nic nie znalazlem co by moglo wskazywac na problem z dyskami.

S.M.A.R.T mówi, ze na pierwszym dysku sa 2 badblocki (byly 3 ale jeden udalo sie usunac)... chociaz sie nimi nie przejmuje, bo one leza w miejscu partycji wolnej (tzw "czekajacej na lindolsa")

Zgodnie z porada znalezniona [ tu ] próbowalem wylaczyc NCQ - bez skutku.

Jak czegos nie dopisalem a potrzebne, to napiszcie.

PS Czy ktos moze poprawic tytul? Bo chyba przez niego przeszedl jakis autokorektor i wyglada dziwacznie i z bledami...

Edytowane Listopad 13, 2010 przez morsik

morsik · Listopad 13, 2010

PING

Bardzo bym prosil o jakiekolwiek wskazówki na ten temat, gdyz problem jest powazny i zaburza normalna prace podczas wykonywania duzych operacji.

@WalDo · Listopad 13, 2010

Nie wiem jak to jest z RAID, ale moze trzeba recznie utworzyc filesystem po to, zeby móc posluzyc sie innymi niz domyslne opcjami. Mysle tutaj o kombinacjach np. z opcja -O , patrz: "man mke2fs". Mozna oczywiscie "podrasowac" istniejace → "man tune2fs".

Ale tak ogólnie to strzelam w ciemno, bo nie mam pojecia co moze byc przyczyna Twoich problemów.

morsik · Listopad 13, 2010

Chyba napiszę mejla do supportu Gigabyte'a w tej sprawie, bo problem systemowy raczej to nie jest...

thof · Listopad 13, 2010

Ja próbowałbym to jakoś diagnozować programem nmon. To równie dobrze może być problem z pamięcią jak i dyskami (kompilacja, pakowanie), ogólnie to IMO hardwarowy. To, że na windowsie jest ok to nic nie znaczy, bo MS specjalizuje się w tego typu odchyleniach od normy Poza tym jak to są nowe dyski i już na starcie pojawiły się badsektory to jest sygnał, że coś jest nie tak, tym bardziej, że to komputer stacjonarny. Jeszcze aktualizacje biosu i monitorowanie napięć (lm_sensors). Zresztą nigdzie nie uzyskasz lepszej pomocy niż na https://bugzilla.kernel.org/

morsik · Listopad 13, 2010

To, ze na windowsie jest ok to nic nie znaczy, bo MS specjalizuje sie w tego typu odchyleniach od normy

Poprawiam - przypomnialem sobie, ze mialem raz/dwa taka sytuacje przywieszenia.

Poza tym jak to sa nowe dyski i juz na starcie pojawily sie badsektory to jest sygnal, ze cos jest nie tak, tym bardziej, ze to komputer stacjonarny.

Badsektory moge tlumaczyc tym, ze Windows chodzil na (jak sie potem okazalo) wadliwerj kosci pamieci, wiec jak sie wywalal, to go trzeba bylo zresetowac i gdzies pewnie na dysku sie czesci zetknely...

Jeszcze aktualizacje biosu i monitorowanie napiec (lm_sensors).

Napiec? Az przez ta sytuacje kupilem nowy zasilacz OCZ ModXStream 600W, bo kupilem z obudowa jakiegos logica... (w opisie obudywy nie bylo napisanej marki zasilacza, jedynie w tytule produktu - myslalem, ze LOGIC to czesc nazwy obudowy :angry:

EDIT:

Uruchomilem wlasnie info o uzyciu dysków w tym nmon. Wyniki sa conajmniej zaskakujace.

sd[ab]5 - RAID1 - /

sd[ab]6 - RAID1 - /home (pomijamy w tescie gdyz dane sa znikome - przypadkiem sie cos pojawilo)

sd[ab]7 - RAID0 - /mnt/data

Co robilem? Rozpakowywalem qt-webkit (z/do /) i odtwarzalem muzyke (/mnt/data). Wyglada jakby dysk(i) mialy problem z zachowaniem równoleglych dzialan. Gdy zapisuje dane, drastycznie spada odczyt. Tym samym muzyke scielo (brakowalo danych), a rozpakowywanie trwalo dluzej... nie bardzo rozumiem, co dyski próbuja zapisac, jesli znacznie mniej czytaja.

Edytowane Listopad 13, 2010 przez morsik

morsik · Listopad 13, 2010

Jeszce maly spam na koniec...

To chyba nie wrózy nic dobrego? Swoja droga, czego dotycza te procenty?

Edit: znalazlem w sieci to:

Top Disk - If this hotest disk is above 60% this could be slowing down performance.

No wiec juz wiem dlaczego tak jest, tylko nie wiem dlaczego [-;

Juz wiem dlaczego sie wszystko zawiesza, jednak nie mam pojecia dlaczego sa takie wartosci... pomine juz to, ze piisze 100.9%... przeciez to powyzej 100%...

Edytowane Listopad 13, 2010 przez morsik

thof · Listopad 13, 2010

Mnie bardziej zaskoczylo to, ze wartosci podane sa w KB, a busy 100% i to na wielu partycjach (tez cos rozpakowalem i umnie busy waha sie 30%-100% na jednej partycji, ale przy lacznym transferze kilkadziesiat MB/s). IMO dyski sa uszkodzone lub przynajmniej jeden. Odpal jeszcze hdparm -Tt /dev/sda( b ).

morsik · Listopad 13, 2010

vader ~ # hdparm -Tt /dev/sda

/dev/sda:
Timing cached reads:   3080 MB in  2.00 seconds = 1540.41 MB/sec
Timing buffered disk reads: 300 MB in  3.13 seconds =  95.95 MB/sec
vader ~ # hdparm -Tt /dev/sdb

/dev/sdb:
Timing cached reads:   3104 MB in  2.00 seconds = 1552.30 MB/sec
Timing buffered disk reads: 308 MB in  3.02 seconds = 102.03 MB/sec

EDIT:

To pokazuje palimpsest z danych ze SMARTa.

/dev/sda: [X] Disk has a few badsectors (2)

/dev/sdb: [X] Disk is healtly

Edytowane Listopad 13, 2010 przez morsik

thof · Listopad 13, 2010

palimpsest jest chyba jeszcze zabugowany. Lepiej to zrobić klasycznie https://wiki.archlinux.org/index.php/SMART#Test_the_hard_drive . Ja na Twoim miejscu rozwaliłbym RAIDA i postawiłbym system na pewnym dysku i zacząłbym testowanie od nowa, bo i tak prawdopodobnie Cię to czeka

morsik · Listopad 13, 2010

palimpsest jest chyba jeszcze zabugowany. Lepiej to zrobic klasycznie https://wiki.archlin..._the_hard_drive . Ja na Twoim miejscu rozwalilbym RAIDA i postawilbym system na pewnym dysku i zaczalbym testowanie od nowa, bo i tak prawdopodobnie Cie to czeka

Tak chyba zrobie. RAIDa rozwalac nie bede, bo juz nie mam na co danych zgrac... poza tym, mam 2 wolne partycje po 80G (jedna dla Windowsa - z badblockami, i druga dla OS X) wiec zainstaluje Fedore na tej dzialajacej w pelni.

vader ~ # smartctl -d -a ata /dev/sda
=== START OF INFORMATION SECTION ===
Model Family: 	Western Digital Caviar Green (Adv. Format) family
Device Model: 	WDC WD6400AARS-00Y5B1
Serial Number:	WD-WMAV51504689
Firmware Version: 80.00A80
User Capacity:	640,135,028,736 bytes
Device is:    	In smartctl database [for details use: -P show]
ATA Version is:   8
ATA Standard is:  Exact ATA specification draft version not indicated
Local Time is:	Sat Nov 13 17:01:22 2010 CET
SMART support is: Available - device has SMART capability.
SMART support is: Enabled

=== START OF READ SMART DATA SECTION ===
SMART overall-health self-assessment test result: PASSED

General SMART Values:
Offline data collection status:  (0x84)	Offline data collection activity
				was suspended by an interrupting command from host.
				Auto Offline Data Collection: Enabled.
Self-test execution status:  	(   0)	The previous self-test routine completed
				without error or no self-test has ever 
				been run.
Total time to complete Offline 
data collection:          (13200) seconds.
Offline data collection
capabilities: 	         (0x7b) SMART execute Offline immediate.
				Auto Offline data collection on/off support.
				Suspend Offline collection upon new
				command.
				Offline surface scan supported.
				Self-test supported.
				Conveyance Self-test supported.
				Selective Self-test supported.
SMART capabilities:        	(0x0003)	Saves SMART data before entering
				power-saving mode.
				Supports SMART auto save timer.
Error logging capability:    	(0x01)	Error logging supported.
				General Purpose Logging supported.
Short self-test routine 
recommended polling time:      (   2) minutes.
Extended self-test routine
recommended polling time:      ( 154) minutes.
Conveyance self-test routine
recommended polling time:      (   5) minutes.
SCT capabilities:        	(0x3031)	SCT Status supported.
				SCT Feature Control supported.
				SCT Data Table supported.

SMART Attributes Data Structure revision number: 16
Vendor Specific SMART Attributes with Thresholds:
ID# ATTRIBUTE_NAME      	FLAG 	VALUE WORST THRESH TYPE  	UPDATED  WHEN_FAILED RAW_VALUE
 1 Raw_Read_Error_Rate 	0x002f   200   200   051	Pre-fail  Always   	-   	0
 3 Spin_Up_Time        	0x0027   124   118   021	Pre-fail  Always   	-   	6800
 4 Start_Stop_Count    	0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	464
 5 Reallocated_Sector_Ct   0x0033   200   200   140	Pre-fail  Always   	-   	0
 7 Seek_Error_Rate 		0x002e   200   200   000	Old_age   Always   	-   	0
 9 Power_On_Hours      	0x0032   098   098   000	Old_age   Always   	-   	1481
10 Spin_Retry_Count    	0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	0
11 Calibration_Retry_Count 0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	0
12 Power_Cycle_Count   	0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	276
192 Power-Off_Retract_Count 0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	131
193 Load_Cycle_Count    	0x0032   188   188   000	Old_age   Always   	-   	36367
194 Temperature_Celsius 	0x0022   112   099   000	Old_age   Always   	-   	35
196 Reallocated_Event_Count 0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	0
197 Current_Pending_Sector  0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	2
198 Offline_Uncorrectable   0x0030   200   200   000	Old_age   Offline  	-   	2
199 UDMA_CRC_Error_Count	0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	0
200 Multi_Zone_Error_Rate   0x0008   200   200   000	Old_age   Offline  	-   	2

SMART Error Log Version: 1
No Errors Logged

SMART Self-test log structure revision number 1
Num  Test_Description	Status              	Remaining  LifeTime(hours)  LBA_of_first_error
# 1  Short offline   	Completed without error   	00%  	1063 		-
# 2  Short offline   	Interrupted (host reset)  	10%  	1061 		-
# 3  Short offline   	Completed without error   	00%   	379 		-

SMART Selective self-test log data structure revision number 1
SPAN  MIN_LBA  MAX_LBA  CURRENT_TEST_STATUS
1    	0    	0  Not_testing
2    	0    	0  Not_testing
3    	0    	0  Not_testing
4    	0    	0  Not_testing
5    	0    	0  Not_testing
Selective self-test flags (0x0):
 After scanning selected spans, do NOT read-scan remainder of disk.
If Selective self-test is pending on power-up, resume after 0 minute delay.

vader ~ # smartctl -d -a ata /dev/sdb
=== START OF INFORMATION SECTION ===
Model Family: 	Western Digital Caviar Green (Adv. Format) family
Device Model: 	WDC WD6400AARS-00Y5B1
Serial Number:	WD-WMAV51567947
Firmware Version: 80.00A80
User Capacity:	640,135,028,736 bytes
Device is:    	In smartctl database [for details use: -P show]
ATA Version is:   8
ATA Standard is:  Exact ATA specification draft version not indicated
Local Time is:	Sat Nov 13 17:02:36 2010 CET
SMART support is: Available - device has SMART capability.
SMART support is: Enabled

=== START OF READ SMART DATA SECTION ===
SMART overall-health self-assessment test result: PASSED

General SMART Values:
Offline data collection status:  (0x84)	Offline data collection activity
				was suspended by an interrupting command from host.
				Auto Offline Data Collection: Enabled.
Self-test execution status:  	(   0)	The previous self-test routine completed
				without error or no self-test has ever 
				been run.
Total time to complete Offline 
data collection:          (13200) seconds.
Offline data collection
capabilities: 	         (0x7b) SMART execute Offline immediate.
				Auto Offline data collection on/off support.
				Suspend Offline collection upon new
				command.
				Offline surface scan supported.
				Self-test supported.
				Conveyance Self-test supported.
				Selective Self-test supported.
SMART capabilities:        	(0x0003)	Saves SMART data before entering
				power-saving mode.
				Supports SMART auto save timer.
Error logging capability:    	(0x01)	Error logging supported.
				General Purpose Logging supported.
Short self-test routine 
recommended polling time:      (   2) minutes.
Extended self-test routine
recommended polling time:      ( 154) minutes.
Conveyance self-test routine
recommended polling time:      (   5) minutes.
SCT capabilities:        	(0x3031)	SCT Status supported.
				SCT Feature Control supported.
				SCT Data Table supported.

SMART Attributes Data Structure revision number: 16
Vendor Specific SMART Attributes with Thresholds:
ID# ATTRIBUTE_NAME      	FLAG 	VALUE WORST THRESH TYPE  	UPDATED  WHEN_FAILED RAW_VALUE
 1 Raw_Read_Error_Rate 	0x002f   200   200   051	Pre-fail  Always   	-   	0
 3 Spin_Up_Time        	0x0027   131   125   021	Pre-fail  Always   	-   	6441
 4 Start_Stop_Count    	0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	363
 5 Reallocated_Sector_Ct   0x0033   200   200   140	Pre-fail  Always   	-   	0
 7 Seek_Error_Rate 		0x002e   200   200   000	Old_age   Always   	-   	0
 9 Power_On_Hours      	0x0032   099   099   000	Old_age   Always   	-   	1314
10 Spin_Retry_Count    	0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	0
11 Calibration_Retry_Count 0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	0
12 Power_Cycle_Count   	0x0032   100   100   000	Old_age   Always   	-   	208
192 Power-Off_Retract_Count 0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	116
193 Load_Cycle_Count    	0x0032   190   190   000	Old_age   Always   	-   	32142
194 Temperature_Celsius 	0x0022   113   101   000	Old_age   Always   	-   	34
196 Reallocated_Event_Count 0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	0
197 Current_Pending_Sector  0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	0
198 Offline_Uncorrectable   0x0030   200   200   000	Old_age   Offline  	-   	0
199 UDMA_CRC_Error_Count	0x0032   200   200   000	Old_age   Always   	-   	0
200 Multi_Zone_Error_Rate   0x0008   200   200   000	Old_age   Offline  	-   	0

SMART Error Log Version: 1
No Errors Logged

SMART Self-test log structure revision number 1
Num  Test_Description	Status              	Remaining  LifeTime(hours)  LBA_of_first_error
# 1  Extended offline	Aborted by host   			10%   	385 		-
# 2  Short offline   	Completed without error   	00%   	379 		-

SMART Selective self-test log data structure revision number 1
SPAN  MIN_LBA  MAX_LBA  CURRENT_TEST_STATUS
1    	0    	0  Not_testing
2    	0    	0  Not_testing
3    	0    	0  Not_testing
4    	0    	0  Not_testing
5    	0    	0  Not_testing
Selective self-test flags (0x0):
 After scanning selected spans, do NOT read-scan remainder of disk.
If Selective self-test is pending on power-up, resume after 0 minute delay.

PS Uruchomilem jeszcze

smartctl -t offline /dev/sda

smartctl -t offline /dev/sdb

Pisze, ze testy skoncza sie o... 20:45

Edytowane Listopad 13, 2010 przez morsik

thof · Listopad 13, 2010

Cieple te Twoje dyski. Takie temperatury powyzej 110 st. C sa normalne?

EDIT: Jak zainstalujesz fedore na tej dzialajacej to musisz testowac tylko w obrebie niej samej. Inne partycje najlepiej jakby nie byly nawet podmontowane.

morsik · Listopad 13, 2010

Cieple te Twoje dyski. Takie temperatury powyzej 110 st. C sa normalne?

Nie wiem dlaczego z tymi wartosciami sie cos nie zgadza, ale przy temp. patrz na RAW_VALUE a nie na VALUE. Tam jest 34°C. I ta temperatura chyba sie nawet nie zmienia po chwili rozpakowywania tego przykladowego qt-webkit.

EDIT: Jak zainstalujesz fedore na tej dzialajacej to musisz testowac tylko w obrebie niej samej. Inne partycje najlepiej jakby nie byly nawet podmontowane.

Okej, to przekopiuje jakies dane z innej na Fedorowa, potem odmontuje i bede kopiowal z miejsca a do b (tak jak dziala rozpakowywanie).

morsik · Listopad 13, 2010

Jako, że po edycji nie widać że się coś zmieniło, piszę nowy post.

Zainstalowałem Fedorę 14 na /dev/sda2 puściłem update i włączyłem nmon.

Co tu dużo mówić... problem jest, choć w minimalnie mniejszym stopniu, no ale hej, my tu mamy od razu pakiety, a nie 100 mega źródeł, dodatkowo bez RAIDu... Tak więc chcąc/niechcąc - coś jest nie tak. Bo dziwne, żeby przy rozpakowywaniu kilku plików, na świeżej instalacji te wartości skakały tak, że pisze DANGER.

thof · Listopad 13, 2010

U mnie też tak jest, że skacze do 100% i pokazuje się DANGER. A jak rozpakowujesz to tylko tak małe są te transfery (w KB)?

Duże I/O Dysku/Ów Powoduję Przywieszenie Systemu.

Rekomendowane odpowiedzi

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Odnośnik do komentarza

Udostępnij na innych stronach

Jeśli chcesz dodać odpowiedź, zaloguj się lub zarejestruj nowe konto

Zarejestruj nowe konto

Zaloguj się